Bereits sehr frühe Kulturen schrieben verschiedenen Steinen eine heilende Wirkung zu. Bei den damals genutzten Naturheilsteinen handelte es sich um Edel- und Halbedelsteine. Dabei wurden verschiedenen Naturheilsteinen auch unterschiedliche Wirkungen auf den Körper zugeschrieben. Die Menschen nutzten die Kraft der Steine, um Leiden zu lindern, aber auch um bestimmte Erkrankungen erst gar nicht aufkommen zu lassen.

Die mystische Kraft der Naturheilsteine hat sich dabei in den Köpfen der Menschen festgesetzt und sich bin in die Neuzeit gehalten. Auch heute noch glauben viele Menschen an die außergewöhnliche Kraft der Naturheilsteine. Die Wirkung, die den Edelsteinen zugeschrieben wird, soll dabei auf dreierlei Weise zustande kommen. Die Farbe des Steins, die durch die Lichtbrechung zustande kommt soll einen Einfluss auf den menschlichen Organismus haben. Durch die Farbe bekommt das Licht eine heilende Energie und entfaltet seine Wirkung. Unterschiedlichen Farben werden dabei unterschiedliche Wirkungen zugeschrieben.

Die unterschiedliche materielle Zusammensetzung der Naturheilsteine begründet die zweite mögliche Art der Wirkung. Edelsteinen unterschiedlicher Zusammensetzung wird eine unterschiedliche Schwingung nachgesagt. Diese  Schwingungen sollen ebenfalls heilend und vorbeugend auf den Körper wirken.

Der dritte Wirkmechanismus liegt in den Mineralien und Spurenelementen der Edelsteine begründet. An einer Kette als Amulett auf der Haut getragen, entfalten diese eine vorbeugende Wirkung. Meiste werden die jeweiligen Naturheilsteine auf die erkrankte Stelle aufgelegt und bleiben dort für einen bestimmten Zeitraum liegen, oder sie werden fest am Körper getragen.Einen wissenschaftlichen Nachweis über die heilende Kraft der Naturheilsteine gibt es indes nicht.

Trotzdem ist der Markt für Naturheilsteine ein boomender Bereich. Viele Menschen, gerade wenn sie von der Schulmedizin austherapiert sind, versuchen den Weg zur Heilung über Naturheilsteine zu finden. Welcher der Naturheilsteine verwendet wird, kommt oft auch darauf an, wer die Person ist, der geholfen werden soll. So sind etwa den einzelnen Sternzeichen unterschiedliche Naturheilsteine zugeordnet. Volkshochschulen und esoterische Vereinigungen bieten oft Grundlehrgänge über die Verwendung der Naturheilsteine an.